MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pTet

Total Repeats: 1132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008790	AAGT	2	8	88	95	50 %	25 %	25 %	0 %	121999252
2	NC_008790	GTT	2	6	116	121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121999252
3	NC_008790	GGA	2	6	149	154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121999252
4	NC_008790	GAA	2	6	202	207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999252
5	NC_008790	TGA	2	6	224	229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999252
6	NC_008790	CA	3	6	304	309	50 %	0 %	0 %	50 %	121999252
7	NC_008790	GGT	3	9	338	346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121999252
8	NC_008790	CAG	2	6	369	374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121999252
9	NC_008790	GAA	2	6	501	506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999252
10	NC_008790	AAG	2	6	523	528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999252
11	NC_008790	CGG	2	6	537	542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121999252
12	NC_008790	TCCG	2	8	565	572	0 %	25 %	25 %	50 %	121999252
13	NC_008790	GT	3	6	611	616	0 %	50 %	50 %	0 %	121999252
14	NC_008790	AGTC	2	8	621	628	25 %	25 %	25 %	25 %	121999252
15	NC_008790	GGA	2	6	689	694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121999252
16	NC_008790	GAA	2	6	754	759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999252
17	NC_008790	GAA	2	6	777	782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999252
18	NC_008790	AAG	2	6	849	854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999252
19	NC_008790	GTG	2	6	893	898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121999252
20	NC_008790	TAT	2	6	947	952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999252
21	NC_008790	AGA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999252
22	NC_008790	GA	3	6	1004	1009	50 %	0 %	50 %	0 %	121999252
23	NC_008790	AG	3	6	1034	1039	50 %	0 %	50 %	0 %	121999252
24	NC_008790	CGAGGA	2	12	1046	1057	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	121999252
25	NC_008790	AAG	2	6	1095	1100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999252
26	NC_008790	GAT	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999252
27	NC_008790	A	6	6	1394	1399	100 %	0 %	0 %	0 %	121999253
28	NC_008790	ATTT	2	8	1441	1448	25 %	75 %	0 %	0 %	121999253
29	NC_008790	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	121999253
30	NC_008790	T	6	6	1485	1490	0 %	100 %	0 %	0 %	121999253
31	NC_008790	A	6	6	1517	1522	100 %	0 %	0 %	0 %	121999254
32	NC_008790	TAA	2	6	1573	1578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999254
33	NC_008790	TAT	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999254
34	NC_008790	T	8	8	1620	1627	0 %	100 %	0 %	0 %	121999254
35	NC_008790	AT	3	6	1643	1648	50 %	50 %	0 %	0 %	121999254
36	NC_008790	GAAAAA	2	12	1662	1673	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121999254
37	NC_008790	GATT	2	8	1675	1682	25 %	50 %	25 %	0 %	121999254
38	NC_008790	AAT	2	6	1706	1711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999254
39	NC_008790	T	7	7	1715	1721	0 %	100 %	0 %	0 %	121999254
40	NC_008790	A	9	9	1948	1956	100 %	0 %	0 %	0 %	121999255
41	NC_008790	A	6	6	1962	1967	100 %	0 %	0 %	0 %	121999255
42	NC_008790	ATTT	2	8	2048	2055	25 %	75 %	0 %	0 %	121999255
43	NC_008790	T	6	6	2053	2058	0 %	100 %	0 %	0 %	121999255
44	NC_008790	ATA	2	6	2107	2112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999255
45	NC_008790	T	6	6	2118	2123	0 %	100 %	0 %	0 %	121999255
46	NC_008790	TC	4	8	2193	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	121999255
47	NC_008790	ATT	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999255
48	NC_008790	T	6	6	2230	2235	0 %	100 %	0 %	0 %	121999255
49	NC_008790	A	6	6	2261	2266	100 %	0 %	0 %	0 %	121999255
50	NC_008790	ATT	2	6	2298	2303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999255
51	NC_008790	A	7	7	2336	2342	100 %	0 %	0 %	0 %	121999255
52	NC_008790	TAG	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999256
53	NC_008790	T	6	6	2368	2373	0 %	100 %	0 %	0 %	121999256
54	NC_008790	TAG	2	6	2395	2400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999256
55	NC_008790	GAT	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999256
56	NC_008790	TATCT	2	10	2419	2428	20 %	60 %	0 %	20 %	121999256
57	NC_008790	TTAT	2	8	2448	2455	25 %	75 %	0 %	0 %	121999256
58	NC_008790	TTA	2	6	2463	2468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999256
59	NC_008790	ATT	2	6	2540	2545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999256
60	NC_008790	T	6	6	2588	2593	0 %	100 %	0 %	0 %	121999256
61	NC_008790	AAAT	2	8	2607	2614	75 %	25 %	0 %	0 %	121999256
62	NC_008790	A	6	6	2647	2652	100 %	0 %	0 %	0 %	121999256
63	NC_008790	TATT	2	8	2668	2675	25 %	75 %	0 %	0 %	121999256
64	NC_008790	TGA	2	6	2701	2706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999256
65	NC_008790	GTT	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121999256
66	NC_008790	T	6	6	2786	2791	0 %	100 %	0 %	0 %	121999256
67	NC_008790	AGG	2	6	2832	2837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121999256
68	NC_008790	AGT	2	6	2847	2852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999257
69	NC_008790	A	6	6	2862	2867	100 %	0 %	0 %	0 %	121999257
70	NC_008790	GTT	2	6	2905	2910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121999257
71	NC_008790	AGA	3	9	2979	2987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999257
72	NC_008790	T	7	7	3015	3021	0 %	100 %	0 %	0 %	121999257
73	NC_008790	A	7	7	3062	3068	100 %	0 %	0 %	0 %	121999257
74	NC_008790	AAG	2	6	3077	3082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999257
75	NC_008790	ATG	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999257
76	NC_008790	AAC	2	6	3115	3120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121999257
77	NC_008790	AGA	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999257
78	NC_008790	ATG	2	6	3170	3175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999257
79	NC_008790	TTA	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999257
80	NC_008790	A	6	6	3271	3276	100 %	0 %	0 %	0 %	121999257
81	NC_008790	AGA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999257
82	NC_008790	AGAAAG	2	12	3329	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999257
83	NC_008790	AG	3	6	3339	3344	50 %	0 %	50 %	0 %	121999257
84	NC_008790	TAA	2	6	3397	3402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999257
85	NC_008790	ATA	3	9	3417	3425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999258
86	NC_008790	TAAA	2	8	3447	3454	75 %	25 %	0 %	0 %	121999258
87	NC_008790	AGA	2	6	3503	3508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999258
88	NC_008790	ATG	2	6	3516	3521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999258
89	NC_008790	AT	3	6	3523	3528	50 %	50 %	0 %	0 %	121999258
90	NC_008790	TA	3	6	3540	3545	50 %	50 %	0 %	0 %	121999258
91	NC_008790	AGA	2	6	3601	3606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999258
92	NC_008790	ATTT	2	8	3659	3666	25 %	75 %	0 %	0 %	121999258
93	NC_008790	ATA	2	6	3732	3737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999259
94	NC_008790	TGT	2	6	3740	3745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121999259
95	NC_008790	A	6	6	3750	3755	100 %	0 %	0 %	0 %	121999259
96	NC_008790	GGT	2	6	3756	3761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121999259
97	NC_008790	T	6	6	3809	3814	0 %	100 %	0 %	0 %	121999259
98	NC_008790	TAT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999259
99	NC_008790	A	8	8	3881	3888	100 %	0 %	0 %	0 %	121999259
100	NC_008790	TGG	2	6	3911	3916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121999259
101	NC_008790	ATT	2	6	3942	3947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999259
102	NC_008790	AAAG	2	8	3948	3955	75 %	0 %	25 %	0 %	121999259
103	NC_008790	TAA	2	6	3956	3961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999259
104	NC_008790	ATT	3	9	3963	3971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999259
105	NC_008790	ATG	2	6	4033	4038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999259
106	NC_008790	GAGAAA	2	12	4074	4085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999259
107	NC_008790	AGT	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999259
108	NC_008790	CTT	2	6	4183	4188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121999259
109	NC_008790	T	6	6	4238	4243	0 %	100 %	0 %	0 %	121999259
110	NC_008790	TTA	2	6	4270	4275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999259
111	NC_008790	ATAA	2	8	4282	4289	75 %	25 %	0 %	0 %	121999259
112	NC_008790	A	8	8	4296	4303	100 %	0 %	0 %	0 %	121999260
113	NC_008790	A	6	6	4347	4352	100 %	0 %	0 %	0 %	121999260
114	NC_008790	GAA	2	6	4383	4388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999260
115	NC_008790	AAG	2	6	4408	4413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999260
116	NC_008790	TAG	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999260
117	NC_008790	A	6	6	4463	4468	100 %	0 %	0 %	0 %	121999260
118	NC_008790	GATTTA	2	12	4475	4486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121999260
119	NC_008790	TA	3	6	4505	4510	50 %	50 %	0 %	0 %	121999260
120	NC_008790	A	7	7	4611	4617	100 %	0 %	0 %	0 %	121999261
121	NC_008790	GAA	2	6	4698	4703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999261
122	NC_008790	CAA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121999261
123	NC_008790	GAAC	2	8	4758	4765	50 %	0 %	25 %	25 %	121999261
124	NC_008790	TCA	2	6	4773	4778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121999261
125	NC_008790	ATA	2	6	4825	4830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999261
126	NC_008790	AG	3	6	4833	4838	50 %	0 %	50 %	0 %	121999261
127	NC_008790	CACAAA	2	12	4907	4918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121999261
128	NC_008790	AAG	2	6	4943	4948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999261
129	NC_008790	AAG	2	6	4954	4959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999261
130	NC_008790	AG	3	6	4958	4963	50 %	0 %	50 %	0 %	121999261
131	NC_008790	AGA	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999261
132	NC_008790	AAAT	2	8	5003	5010	75 %	25 %	0 %	0 %	121999261
133	NC_008790	TCAA	2	8	5012	5019	50 %	25 %	0 %	25 %	121999261
134	NC_008790	ATG	3	9	5065	5073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999261
135	NC_008790	TGC	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121999261
136	NC_008790	AAG	2	6	5096	5101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999261
137	NC_008790	CAA	2	6	5109	5114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121999261
138	NC_008790	GCA	2	6	5130	5135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121999261
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